В период пролета обычен на всей территории Тобол-Ишимского междуречья и Тургайской ложбины как весной, так и осенью. Здесь пролетает не меньше нескольких тысяч птиц. В наибольшем числе останавливаются на озерах Наурзума, а также на озерах Кулагуль, Санкебай, Тюнтюгур; в сентябре на отдельных озерах их скопления достигают 500 и более птиц. Осенью, вероятно, основная масса кликунов летит по Тургайской ложбине к озерам низовий Тургая и Иргиза, и лишь небольшая часть уходит на юго-запад.

Во всяком случае, на озерах в центральной и западной части Сыпсынагашской

ложбины они немногочисленны. В 1993 г. на Сарымоине отмечена линька более 600 кликунов. Гнездование возможно на крупных пресных озерах. В Наурзумском заповеднике в 1980-е годы ежегодно отмечалось 2–5 выводков на озерах Малый и Большой Аксуат, Жарколь. В 1990-х гг., особенно во второй половине, численность кликунов на фоне исчезновения шипуна заметно увеличилась – в 1998–2001 гг. они составляли около 75% всех лебедей, причем на наиболее обсохших озерах был представлен только этот вид.

Гнездование отмечено на оз. Тениз (близ пос. Уркаш), Кулыколь, Шошкалы. В Наурзуме в 2000 г. на двух плесах оз. Жарколь, сохраняющих минимальный уровень воды, гнездились 3 пары кликунов и еще 2 пары вывели птенцов на небольшом озере в лесном массиве Сыпсын и на пруду у высохшего оз. Жарман.